Osoba ubiegająca się o stopień doktora w trybie eksternistycznym wnosi opłatę za przeprowadzenie postępowania w tej sprawie. Na opłatę składają się rzeczywiście poniesione przez Akademię koszty, a w szczególności koszty wynagrodzenia promotora lub promotora i promotora pomocniczego, wynagrodzenia recenzentów, niezależnie od wyniku sporządzonej przez nich recenzji, podwyższone o pochodne od wynagrodzeń z przypadającymi od nich należnościami publicznoprawnymi, w szczególności składkami na ubezpieczenie społeczne i zdrowotne należnymi zgodnie z odrębnymi przepisami, a także koszty podróży i noclegów promotora, promotora pomocniczego i recenzentów niebędących pracownikami Akademii w związku z ich udziałem w publicznej obronie rozprawy doktorskiej a także koszty ogólnoadministracyjne.
W uzasadnionych przypadkach Kandydat może ubiegać się o rozłożenie płatności za przeprowadzenie postępowania w sprawie nadania stopnia doktora w trybie eksternistycznym na raty.
Ponadto Kandydat zobowiązany jest do uiszczenia opłaty rekrutacyjnej wynoszącej 900 zł, którą należy uiścić w terminie do dwóch tygodni od dnia podpisania umowy, oraz czesnego za udział w seminarium doktorskim, które wynosi 600 zł miesięcznie.